如何设计并评估蛋白序列

1、功能说明

输入蛋白骨架结构或 PDB ID,系统可基于 ProteinMPNN 设计新的氨基酸序列,帮助用户获得候选蛋白序列,并用于后续结构预测、稳定性评估和蛋白优化研究。

2 案例展示

2.1 基于 ProteinMPNN 的四螺旋束蛋白序列设计与稳定性验证

2.1.1 输入需求

 给定一个四螺旋束骨架结构(PDB: 1JMB),用ProteinMPNN重新设计氨基酸序列以提高热稳定性

 参考链接

  提交后将进行以下步骤:

  • 查询PDB ID (1JMB),给出了ProteinMPNN设计参数预检

  • 温度选择原因和后续计划

  • 回答“确认”,提交序列设计任务

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  • 确认之后,可以看到设计结果分析

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2.1.2、结果验证

  • 提供验证计划和结果

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