如何设计并评估蛋白序列
1、功能说明
输入蛋白骨架结构或 PDB ID,系统可基于 ProteinMPNN 设计新的氨基酸序列,帮助用户获得候选蛋白序列,并用于后续结构预测、稳定性评估和蛋白优化研究。
2 案例展示
2.1 基于 ProteinMPNN 的四螺旋束蛋白序列设计与稳定性验证
2.1.1 输入需求
给定一个四螺旋束骨架结构(PDB: 1JMB),用ProteinMPNN重新设计氨基酸序列以提高热稳定性
提交后将进行以下步骤:
查询PDB ID (1JMB),给出了ProteinMPNN设计参数预检
温度选择原因和后续计划
回答“确认”,提交序列设计任务

确认之后,可以看到设计结果分析

2.1.2、结果验证
提供验证计划和结果

